Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NIPSNAP1Q9BPW8 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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NIPSNAP1Q9BPW8 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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