Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms