Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms