Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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