Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF548Q8NEK5 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF548Q8NEK5 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF548Q8NEK5 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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