Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms