Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCL2Q8N4E4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms