Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPAP2Q8IXW5 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms