Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms