Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms