Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms