Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms