Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A12Q504Y0 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms