Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC1Q4ZHG4 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms