Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EDRF1Q3B7T1 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms