Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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