Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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EXT1Q16394 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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EXT1Q16394 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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EXT1Q16394 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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EXT1Q16394 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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EXT1Q16394 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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EXT1Q16394 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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EXT1Q16394 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
EXT1Q16394 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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EXT1Q16394 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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EXT1Q16394 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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EXT1Q16394 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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EXT1Q16394 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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EXT1Q16394 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
EXT1Q16394 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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