Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AL392088.1-201ENST00000428364 670 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
E2F4Q16254 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.1 ms