Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms