Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 EPHB6-202ENST00000422643 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 SPACA6P-AS-201ENST00000602324 3962 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 IDS-201ENST00000340855 7619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 HYPK-201ENST00000406925 4777 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 EIF4E3-205ENST00000448225 6209 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 PDIK1L-204ENST00000619836 4252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TSPEAR-204ENST00000614657 4027 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 NTNG1-207ENST00000370073 3347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 SMARCE1-202ENST00000348513 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 RHBDL3-201ENST00000269051 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 SLC44A4-203ENST00000375562 2505 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 WDR41-201ENST00000296679 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 ZKSCAN5-202ENST00000394170 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 C14orf119-201ENST00000319074 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 G2E3-202ENST00000438909 2334 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 EMG1-202ENST00000599672 4898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 OTUD6B-201ENST00000285420 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 SEPT6-205ENST00000394610 4694 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 RGPD5-203ENST00000393283 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 ZNF827-201ENST00000379448 4197 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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