Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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TAF1AQ15573 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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TAF1AQ15573 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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TAF1AQ15573 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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