Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 RRNAD1-204ENST00000476229 1096 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
R3HDM1Q15032 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms