Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 AC098483.1-201ENST00000438623 955 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 AC010618.2-201ENST00000596192 460 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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LAPTM4AQ15012 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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LAPTM4AQ15012 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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LAPTM4AQ15012 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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