Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GBX1Q14549 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GBX1Q14549 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GBX1Q14549 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GBX1Q14549 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GBX1Q14549 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GBX1Q14549 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GBX1Q14549 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GBX1Q14549 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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GBX1Q14549 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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