Protein–RNA interactions for Protein: Q14019

COTL1, Coactosin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COTL1Q14019 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 LINC02133-202ENST00000569726 2626 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 FGF11-202ENST00000572907 2358 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 GCM1-201ENST00000259803 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 GOLGA8F-201ENST00000526619 5237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
COTL1Q14019 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms