Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ITGA9Q13797 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ITGA9Q13797 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ITGA9Q13797 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ITGA9Q13797 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ITGA9Q13797 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ITGA9Q13797 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ITGA9Q13797 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ITGA9Q13797 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ITGA9Q13797 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGA9Q13797 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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