Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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