Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDH17Q12864 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms