Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms