Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 240 ms