Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms