Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms