Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP46P62068 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP46P62068 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP46P62068 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms