Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ERVFC1P60507 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms