Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL23P55773 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL23P55773 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL23P55773 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL23P55773 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL23P55773 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL23P55773 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL23P55773 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL23P55773 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL23P55773 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL23P55773 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL23P55773 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL23P55773 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL23P55773 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL23P55773 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL23P55773 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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