Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSRP3P50461 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms