Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RANGAP1P46060 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RANGAP1P46060 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RANGAP1P46060 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RANGAP1P46060 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RANGAP1P46060 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RANGAP1P46060 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RANGAP1P46060 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RANGAP1P46060 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RANGAP1P46060 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RANGAP1P46060 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RANGAP1P46060 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RANGAP1P46060 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RANGAP1P46060 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RANGAP1P46060 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RANGAP1P46060 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RANGAP1P46060 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RANGAP1P46060 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
RANGAP1P46060 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RANGAP1P46060 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RANGAP1P46060 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RANGAP1P46060 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RANGAP1P46060 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms