Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms