Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCAP28676 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCAP28676 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCAP28676 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCAP28676 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCAP28676 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCAP28676 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GCAP28676 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCAP28676 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCAP28676 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GCAP28676 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GCAP28676 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GCAP28676 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCAP28676 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCAP28676 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GCAP28676 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms