Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 GFRA1-203ENST00000369236 9109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 GPR179-204ENST00000621958 7983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PLNP26678 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PLNP26678 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms