Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDCP19113 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDCP19113 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms