Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRAP18433 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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PTPRAP18433 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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PTPRAP18433 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PTPRAP18433 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PTPRAP18433 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PTPRAP18433 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PTPRAP18433 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PTPRAP18433 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PTPRAP18433 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PTPRAP18433 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRAP18433 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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