Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EPCAMP16422 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms