Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNAP02545 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNAP02545 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNAP02545 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNAP02545 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNAP02545 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNAP02545 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNAP02545 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNAP02545 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNAP02545 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNAP02545 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNAP02545 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNAP02545 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNAP02545 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNAP02545 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNAP02545 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNAP02545 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNAP02545 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNAP02545 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNAP02545 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNAP02545 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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