Protein–RNA interactions for Protein: P01768

IGHV3-30, Immunoglobulin heavy variable 3-30, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-30P01768 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-30P01768 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms