Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKAP2O75563 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms