Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3O43889 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3O43889 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CREB3O43889 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms