Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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MSI1O43347 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSI1O43347 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSI1O43347 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSI1O43347 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSI1O43347 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSI1O43347 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSI1O43347 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MSI1O43347 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSI1O43347 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSI1O43347 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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MSI1O43347 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSI1O43347 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSI1O43347 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSI1O43347 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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MSI1O43347 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSI1O43347 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSI1O43347 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSI1O43347 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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MSI1O43347 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSI1O43347 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MSI1O43347 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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MSI1O43347 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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MSI1O43347 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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MSI1O43347 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSI1O43347 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSI1O43347 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSI1O43347 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSI1O43347 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSI1O43347 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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