Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms