Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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